在各个抗日根据地建立的青救会组织在中国共产党的领导下,带领青年投身抗日游击战争、发展生产、参加民主政权建设和文化建设等根据地的各方面工作,使广大青少年成为完成抗日战争各项任务的一股重要的力量。在各敌后抗日根据地活跃着各种青年抗日武装,如青年抗日先锋队(简称“青抗先”)、抗日青年队、青年游击小组等。他们积极配合正规部队开展游击战,给侵略者以沉重的打击。在根据地的政权建设中,青年也是一支重要的力量,在晋察冀根据地6个县的统计中可见一斑,青年在区级参议员中占34.8%,在县级参议员中占37.8%,担任县长的占40.8%。在抗日根据地的文化建设中,青年人更是一支活跃的力量,在青救会的组织领导下,广大青年组织了秧歌队、剧团、识字班等,有效地促进了根据地的文化工作的发展。青救会开办的安吴青训班、毛泽东青干校则成为培养青年干部的熔炉。毛泽东在1939年5月4日曾发表著名演讲《青年运动的方向》,高度评价了抗日根据地的青年工作,同时对中国青年运动方向的问题进行了科学的阐述和概括。
在国民党统治区和沦陷区,青年抗日救国组织的工作受到多种限制乃至镇压,工作环境极其恶劣,但是这些组织的成员在共产党的领导下,采取机动灵活的方式开展抗日救国活动,广泛团结各界青年,扩大抗日民族统一战线的影响,同各种破坏团结抗战的行为和主张作坚决的斗争,同日伪政权和武装作殊死的搏斗,为夺取抗日战争的最后胜利做出了重要贡献。
在抗日战争时期,虽然共青团组织被改造,但是党领导下的青年组织的工作并没有中断。党通过这一时期领导青年抗日救亡组织的实践,积累了丰富的群众工作经验,极大地丰富了青年团的工作理论和指导思想,为后来青年团组织的进一步发展奠定了坚实的基础。